8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35227
Cell Name :  AM-C1A
Archive Name :  Henckens
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  400 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Chronic stress
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-02-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  AM-C1A.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stress-induced alterations in large-scale functional networks of the rodent brain.

Measurements
Soma Surface :  2027.49 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  58
Overall Width :  235.55 μm
Overall Height :  513.94 μm
Overall Depth :  139.34 μm
Average Diameter :  1.22 μm
Total Length :  3374.97 μm
Total Surface :  13625.1 μm2
Total Volume :  6390.9 μm3
Max Euclidean Distance :  452.79 μm
Max Path Distance :  543.64 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  807
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.3
Average Bifurcation Angle Local :  71.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.03°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website