8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_89856
Cell Name :  AE-I-10-pc1-PY_C14
Archive Name :  Diniz
Species Name :  mouse
Strain :  Albino
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  environmental enrichment + Piry virus-infected
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  70  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 75% in z
Corrected 75%
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-12-12
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  AE-I-10-pc1-PY_C14.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis of microglial changes in a mouse model of virus encephalitis: age and environmental influences.

Measurements
Soma Surface :  181.5 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  48
Overall Width :  43.45 μm
Overall Height :  15.23 μm
Overall Depth :  2.31 μm
Average Diameter :  0.66 μm
Total Length :  211.98 μm
Total Surface :  463.62 μm2
Total Volume :  109.55 μm3
Max Euclidean Distance :  30.35 μm
Max Path Distance :  33.87 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  213
Partition Asymmetry :  0.35
Average Rall's Ratio :  1.33
Average Bifurcation Angle Local :  69.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.62°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website