8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_110917
Cell Name :  AAV-TC-Batch-I-lif-1666-II-exported-001
Archive Name :  Ribic
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  lateral geniculate nucleus
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  thalamocortical
Tertiary Cell Class :  relay, primary visual cortex projecting
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  80  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2019-02-19
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  AAV-TC-Batch-I-lif-1666-II-exported-001.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Synapse-Selective Control of Cortical Maturation and Plasticity by Parvalbumin-Autonomous Action of SynCAM 1.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  29
Overall Width :  42.55 μm
Overall Height :  103.19 μm
Overall Depth :  29.88 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  362.75 μm
Total Surface :  284.9 μm2
Total Volume :  17.81 μm3
Max Euclidean Distance :  121.79 μm
Max Path Distance :  163.51 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  704
Partition Asymmetry :  0.73
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  81.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.87°
Fractal Dimension :  1.08

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website