8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_260093
Cell Name :  AA1540
Archive Name :  MouseLight
Species Name :  mouse
Strain :  C56BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  25  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer
Date of Deposition :  2022-03-05
Date of Upload :  2023-05-04
Persistence Vector :  AA1540.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Single-neuron axonal reconstruction: The search for a wiring diagram of the brain.

Measurements
Soma Surface :  12.39 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  154
Number of Branches :  319
Overall Width :  2473.9 μm
Overall Height :  7812.9 μm
Overall Depth :  6653.14 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  55493.1 μm
Total Surface :  348673 μm2
Total Volume :  174337 μm3
Max Euclidean Distance :  9742.53 μm
Max Path Distance :  12109.7 μm
Max Branch Order :  29
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  5692
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  69.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.61°
Fractal Dimension :  1.02

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