8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_260087
Cell Name :  AA1074
Archive Name :  MouseLight
Species Name :  mouse
Strain :  C56BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  pons
Secondary Brain Region :  pontine tegmentum
Tertiary Brain Region :  reticular nucleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  25  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer
Date of Deposition :  2020-04-20
Date of Upload :  2023-05-04
Persistence Vector :  AA1074.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Single-neuron axonal reconstruction: The search for a wiring diagram of the brain.

Measurements
Soma Surface :  12.35 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  57
Number of Branches :  123
Overall Width :  5633.98 μm
Overall Height :  1571.31 μm
Overall Depth :  4676.87 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  27658.3 μm
Total Surface :  173782 μm2
Total Volume :  86891.2 μm3
Max Euclidean Distance :  5501.66 μm
Max Path Distance :  14311.6 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  3517
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  71.88°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.13°
Fractal Dimension :  1.03

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