8.6.75 - Released: 2025-03-17 - Content: 273533 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_260145
Cell Name :  AA1062
Archive Name :  MouseLight
Species Name :  mouse
Strain :  C56BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  hindbrain
Tertiary Brain Region :  vestibular nucleus, medial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  25  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer
Date of Deposition :  2020-04-20
Date of Upload :  2023-05-04
Persistence Vector :  AA1062.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Single-neuron axonal reconstruction: The search for a wiring diagram of the brain.

Measurements
Soma Surface :  12.38 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  114
Number of Branches :  234
Overall Width :  3913.67 μm
Overall Height :  2114.4 μm
Overall Depth :  5457.73 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  60230 μm
Total Surface :  378436 μm2
Total Volume :  189218 μm3
Max Euclidean Distance :  4630.16 μm
Max Path Distance :  17944.6 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1266
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  63.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.31°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website