8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_260124
Cell Name :  AA1028
Archive Name :  MouseLight
Species Name :  mouse
Strain :  C56BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  pons
Secondary Brain Region :  pontine tegmentum
Tertiary Brain Region :  reticular nucleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  projection
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  25  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer
Date of Deposition :  2020-04-20
Date of Upload :  2023-05-04
Persistence Vector :  AA1028.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Single-neuron axonal reconstruction: The search for a wiring diagram of the brain.

Measurements
Soma Surface :  12.44 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  133
Number of Branches :  273
Overall Width :  4537.09 μm
Overall Height :  5010.04 μm
Overall Depth :  3027.13 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  57978 μm
Total Surface :  364286 μm2
Total Volume :  182143 μm3
Max Euclidean Distance :  5913.23 μm
Max Path Distance :  11536.3 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1942
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  72.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.89°
Fractal Dimension :  1.02

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