8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_121919
Cell Name :  AA0554
Archive Name :  MouseLight
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  secondary motor, layer 6a
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  25  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer
Date of Deposition :  2019-10-02
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AA0554.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Reconstruction of 1000 Projection Neurons Reveals New Cell Types and Organization of Long-Range Connectivity in the Mouse Brain

Measurements
Soma Surface :  12.3 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  78
Number of Branches :  163
Overall Width :  1972.94 μm
Overall Height :  4765.97 μm
Overall Depth :  2362.22 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  35430.6 μm
Total Surface :  27827.1 μm2
Total Volume :  1739.2 μm3
Max Euclidean Distance :  4697.26 μm
Max Path Distance :  7854.19 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  3814
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  57.23°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.94°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website