8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_121578
Cell Name :  AA0340
Archive Name :  MouseLight
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  Ventral anterior-lateral complex of the thalamus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  25  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Janelia Workstation-Large Volume Viewer
Date of Deposition :  2019-10-02
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  AA0340.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Reconstruction of 1000 Projection Neurons Reveals New Cell Types and Organization of Long-Range Connectivity in the Mouse Brain

Measurements
Soma Surface :  12.35 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  619
Number of Branches :  1248
Overall Width :  1619.09 μm
Overall Height :  3036.42 μm
Overall Depth :  4192.92 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  115591 μm
Total Surface :  90785.3 μm2
Total Volume :  5674.08 μm3
Max Euclidean Distance :  4820.87 μm
Max Path Distance :  6829.16 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  4217
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  63.83°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.78°
Fractal Dimension :  1.01

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