8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_250046
Cell Name :  A4Control_1
Archive Name :  Garcia-Hernandez_DeSantis
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x , 40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2022-11-02
Date of Upload :  2022-12-07
Persistence Vector :  A4Control_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Mapping microglia and astrocyte activation in vivo using diffusion MRI.

Measurements
Soma Surface :  210.75 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  50
Overall Width :  56.62 μm
Overall Height :  57.6 μm
Overall Depth :  3.06 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  499.66 μm
Total Surface :  392.43 μm2
Total Volume :  24.53 μm3
Max Euclidean Distance :  42.59 μm
Max Path Distance :  59.46 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  335
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  91.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.77°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website