8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141810
Cell Name :  A3_6dpf_trace1
Archive Name :  Sitaraman
Species Name :  zebrafish
Strain :  Indian-wildtype
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  cerebellar cortex
Tertiary Brain Region :  Purkinje layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Purkinje
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2020-08-13
Date of Upload :  2020-10-22
Persistence Vector :  A3_6dpf_trace1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Gjd2b-mediated gap junctions promote glutamatergic synapse formation and dendritic elaboration in Purkinje neurons

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  17
Overall Width :  17.14 μm
Overall Height :  15.08 μm
Overall Depth :  23.7 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  107.1 μm
Total Surface :  84.12 μm2
Total Volume :  5.26 μm3
Max Euclidean Distance :  29.45 μm
Max Path Distance :  52.48 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  401
Partition Asymmetry :  0.88
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  112.36°
Average Bifurcation Angle Remote :  120.48°
Fractal Dimension :  1.13

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website