8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77303
Cell Name :  A3-CA1-L-D63x1zACR3
Archive Name :  King
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum, left
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  overpressure-exposed
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2017-07-13
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  A3-CA1-L-D63x1zACR3.pvec
Note :  3 hour incubation time; source confocal images: https://doi.org/10.5061/dryad.t7f64

Reference Article
Related Article Reference :  Simulated blast overpressure induces specific astrocyte injury in an ex vivo brain slice model.

Measurements
Soma Surface :  44.34 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  37
Overall Width :  4.39 μm
Overall Height :  18.44 μm
Overall Depth :  44.82 μm
Average Diameter :  0.86 μm
Total Length :  159.05 μm
Total Surface :  563.74 μm2
Total Volume :  221.87 μm3
Max Euclidean Distance :  27.15 μm
Max Path Distance :  38.78 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  177
Partition Asymmetry :  0.74
Average Rall's Ratio :  5.3
Average Bifurcation Angle Local :  83.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.02°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website