8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77246
Cell Name :  A3-CA1-L-A63x1zACR2
Archive Name :  King
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum, left
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  overpressure-exposed
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2017-07-13
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  A3-CA1-L-A63x1zACR2.pvec
Note :  2 hour incubation time; source confocal images: https://doi.org/10.5061/dryad.t7f64

Reference Article
Related Article Reference :  Simulated blast overpressure induces specific astrocyte injury in an ex vivo brain slice model.

Measurements
Soma Surface :  23.29 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  7
Overall Width :  2.38 μm
Overall Height :  20.59 μm
Overall Depth :  20.91 μm
Average Diameter :  1.24 μm
Total Length :  49.47 μm
Total Surface :  263.61 μm2
Total Volume :  136.4 μm3
Max Euclidean Distance :  23.9 μm
Max Path Distance :  25.2 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  39
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.17
Average Bifurcation Angle Local :  68.48°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.09°
Fractal Dimension :  1.01

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