8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77285
Cell Name :  A3-CA1-L-A63x1zACR1_1
Archive Name :  King
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum, left
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  overpressure-exposed
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2017-07-13
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  A3-CA1-L-A63x1zACR1_1.pvec
Note :  3 hour incubation time; source confocal images: https://doi.org/10.5061/dryad.t7f64

Reference Article
Related Article Reference :  Simulated blast overpressure induces specific astrocyte injury in an ex vivo brain slice model.

Measurements
Soma Surface :  197.46 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  18
Overall Width :  2.53 μm
Overall Height :  15.56 μm
Overall Depth :  23.26 μm
Average Diameter :  0.72 μm
Total Length :  91.37 μm
Total Surface :  370.44 μm2
Total Volume :  250.06 μm3
Max Euclidean Distance :  15.35 μm
Max Path Distance :  19.42 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  98
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  1.21
Average Bifurcation Angle Local :  65.96°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.9°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website