8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_05564
Cell Name :  A2-June2-IR1-3-E
Archive Name :  Luebke
Species Name :  mouse
Strain :  C57B6/SJL
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  9.0 months
Max Age :  9.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-08-09
Date of Upload :  2010-02-16
Persistence Vector :  A2-June2-IR1-3-E.pvec
Note :  Wildtype

Reference Article
Related Article Reference :  Structural and functional changes in tau mutant mice neurons are not linked to the presence of NFTs.

Measurements
Soma Surface :  84.49 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  84
Overall Width :  230.93 μm
Overall Height :  373.93 μm
Overall Depth :  52.88 μm
Average Diameter :  1.19 μm
Total Length :  4001.93 μm
Total Surface :  15034.1 μm2
Total Volume :  4894.54 μm3
Max Euclidean Distance :  290.57 μm
Max Path Distance :  360.16 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1536
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  2.17
Average Bifurcation Angle Local :  66.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  62°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website