8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77274
Cell Name :  A2-CA1-R-H63x1zACR1
Archive Name :  King
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  300 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  stratum radiatum, right
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  overpressure-exposed
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2017-07-13
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  A2-CA1-R-H63x1zACR1.pvec
Note :  2 hour incubation time; source confocal images: https://doi.org/10.5061/dryad.t7f64

Reference Article
Related Article Reference :  Simulated blast overpressure induces specific astrocyte injury in an ex vivo brain slice model.

Measurements
Soma Surface :  27.19 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  18
Overall Width :  1.61 μm
Overall Height :  15.6 μm
Overall Depth :  21.4 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  83.53 μm
Total Surface :  348.15 μm2
Total Volume :  165.44 μm3
Max Euclidean Distance :  13.7 μm
Max Path Distance :  19.08 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  77
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  4.57
Average Bifurcation Angle Local :  82.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.72°
Fractal Dimension :  1.02

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