8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35918
Cell Name :  A1-9-IR3-5-h
Archive Name :  Luebke
Species Name :  mouse
Strain :  FVB/129
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, Streptavidin-Alexa 546
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-08-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  A1-9-IR3-5-h.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electrophysiological changes precede morphological changes to frontal cortical pyramidal neurons in the rTg4510 mouse model of progressive tauopathy.

Measurements
Soma Surface :  810.71 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  62
Number of Branches :  130
Overall Width :  218.3 μm
Overall Height :  503.78 μm
Overall Depth :  104.53 μm
Average Diameter :  0.08 μm
Total Length :  5222.09 μm
Total Surface :  1312.45 μm2
Total Volume :  26.25 μm3
Max Euclidean Distance :  428.04 μm
Max Path Distance :  481.9 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  3483
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  62.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.7°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website