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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35910
Cell Name :  A1-1-IR2-2-c
Archive Name :  Luebke
Species Name :  mouse
Strain :  FVB/129
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, Streptavidin-Alexa 546
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-08-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  A1-1-IR2-2-c.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electrophysiological changes precede morphological changes to frontal cortical pyramidal neurons in the rTg4510 mouse model of progressive tauopathy.

Measurements
Soma Surface :  475.53 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  60
Number of Branches :  128
Overall Width :  205.28 μm
Overall Height :  391.08 μm
Overall Depth :  207.43 μm
Average Diameter :  0.08 μm
Total Length :  6009.14 μm
Total Surface :  1510.26 μm2
Total Volume :  30.21 μm3
Max Euclidean Distance :  349.01 μm
Max Path Distance :  404.93 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  7263
Partition Asymmetry :  0.35
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  53.39°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.21°
Fractal Dimension :  1.02

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