8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_131292
Cell Name :  9D4neuron2
Archive Name :  Ellender
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny, apical intermediate progenitor (aIP)-derived
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in utero
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-04-14
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  9D4neuron2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Embryonic progenitor pools generate diversity in fine-scale excitatory cortical subnetworks.

Measurements
Soma Surface :  486.17 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  24
Overall Width :  134.79 μm
Overall Height :  189.23 μm
Overall Depth :  70.11 μm
Average Diameter :  0.91 μm
Total Length :  1190.27 μm
Total Surface :  3458.18 μm2
Total Volume :  848.02 μm3
Max Euclidean Distance :  140.44 μm
Max Path Distance :  216.14 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  1332
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.79
Average Bifurcation Angle Local :  67.14°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.17°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website