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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145797
Cell Name :  912-12wk-NPC-CD68-IBA1-Calb-60X-1b
Archive Name :  Kavetsky
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J-Npc1nmf164/J;Npc1nmf16
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  vermis
Tertiary Brain Region :  anterior, lobule I-IV
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive, CD68-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  NPC1 mutant
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-10-12
Date of Upload :  2020-12-09
Persistence Vector :  912-12wk-NPC-CD68-IBA1-Calb-60X-1b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Increased interactions and engulfment of dendrites by microglia precede Purkinje cell degeneration in a mouse model of Niemann Pick Type-C.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  6
Overall Width :  5.17 μm
Overall Height :  27.1 μm
Overall Depth :  12.53 μm
Average Diameter :  1.1 μm
Total Length :  65.18 μm
Total Surface :  231.68 μm2
Total Volume :  76.17 μm3
Max Euclidean Distance :  17.24 μm
Max Path Distance :  23.62 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  277
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2.12
Average Bifurcation Angle Local :  36.37°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.07°
Fractal Dimension :  1.04

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