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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_145761
Cell Name :  903-12wk-NPC-IBA1-CD68-CALB-63X-1000a
Archive Name :  Kavetsky
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J-Npc1nmf164/J;Npc1nmf16
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  vermis
Tertiary Brain Region :  anterior, lobule I-IV
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive, CD68-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  NPC1 mutant
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-10-12
Date of Upload :  2020-12-09
Persistence Vector :  903-12wk-NPC-IBA1-CD68-CALB-63X-1000a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Increased interactions and engulfment of dendrites by microglia precede Purkinje cell degeneration in a mouse model of Niemann Pick Type-C.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  3.91 μm
Overall Height :  28.85 μm
Overall Depth :  19.85 μm
Average Diameter :  0.98 μm
Total Length :  75.09 μm
Total Surface :  231.49 μm2
Total Volume :  63.27 μm3
Max Euclidean Distance :  23.67 μm
Max Path Distance :  36.79 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  310
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  46.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.05°
Fractal Dimension :  1.04

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