8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_129477
Cell Name :  8-11-17-exp-slice1-RH-cell-SNc
Archive Name :  Kosillo
Species Name :  mouse
Strain :  Tsc1 wt/wt;DAT-IRES-Cre wt/+
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  275  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-01-30
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  8-11-17-exp-slice1-RH-cell-SNc.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Tsc1-mTORC1 signaling controls striatal dopamine release and cognitive flexibility.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  32
Overall Width :  224.3 μm
Overall Height :  398.19 μm
Overall Depth :  21.1 μm
Average Diameter :  1.7 μm
Total Length :  1662.23 μm
Total Surface :  8748.69 μm2
Total Volume :  5997.3 μm3
Max Euclidean Distance :  321.84 μm
Max Path Distance :  354.9 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  3953
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2.39
Average Bifurcation Angle Local :  59.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.57°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website