8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_50872
Cell Name :  77dpi_contra_infra_01
Archive Name :  Beining
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.2 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  220 grams
Max Weight :  450 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, infrapyramidal blade
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  adult-born
Original Format :  Trees Toolbox.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein, Alexa Fluor 488, immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  TREES toolbox
Date of Deposition :  2016-01-16
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  77dpi_contra_infra_01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult-born dentate granule cells show a critical period of dendritic reorganization and are distinct from developmentally born cells.

Measurements
Soma Surface :  223.8 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  21
Overall Width :  163.45 μm
Overall Height :  296.54 μm
Overall Depth :  151.82 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1955.77 μm
Total Surface :  6153.23 μm2
Total Volume :  1817.79 μm3
Max Euclidean Distance :  326.26 μm
Max Path Distance :  363.97 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1971
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  49°
Average Bifurcation Angle Remote :  31.81°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website