8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90428
Cell Name :  6e31f43000003313972109__vrobl__9835b5
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  0.03  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-17
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  6e31f43000003313972109__vrobl__9835b5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-volume en-bloc staining for electron microscopy-based connectomics.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  6
Overall Width :  1.55 μm
Overall Height :  11.16 μm
Overall Depth :  4.16 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  24.77 μm
Total Surface :  19.45 μm2
Total Volume :  1.22 μm3
Max Euclidean Distance :  11.2 μm
Max Path Distance :  14.85 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  168
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  110.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  132.91°
Fractal Dimension :  1.09

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