8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90420
Cell Name :  6e31f43000003213972107__rkneissl__981244
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  0.03  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-17
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  6e31f43000003213972107__rkneissl__981244.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-volume en-bloc staining for electron microscopy-based connectomics.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  54
Overall Width :  3.03 μm
Overall Height :  12.29 μm
Overall Depth :  3.84 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  68.4 μm
Total Surface :  53.72 μm2
Total Volume :  3.36 μm3
Max Euclidean Distance :  11.47 μm
Max Path Distance :  14.7 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  285
Partition Asymmetry :  0.83
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  94.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  95.03°
Fractal Dimension :  1.09

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