8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108606
Cell Name :  6dpf_1
Archive Name :  Montgomery_Masino
Species Name :  zebrafish
Strain :  Tg(pet1:gal4-p2A-EGFP)gy1 & Tg(UAS:Kaede)s1999t
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  spinal cord
Secondary Brain Region :  ventral
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  serotonergic
Tertiary Cell Class :  Intraspinal
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Kaede fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2018-11-15
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  6dpf_1.pvec
Note :  Confocal images from lateral perspective

Reference Article
Related Article Reference :  Intraspinal serotonergic signaling suppresses locomotor activity in larval zebrafish.

Measurements
Soma Surface :  65.55 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  14
Overall Width :  107.95 μm
Overall Height :  14.76 μm
Overall Depth :  16.34 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  214.39 μm
Total Surface :  168.38 μm2
Total Volume :  10.52 μm3
Max Euclidean Distance :  71.64 μm
Max Path Distance :  90.2 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  539
Partition Asymmetry :  0.39
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  45.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.87°
Fractal Dimension :  1.11

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website