8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_63157
Cell Name :  6_6_1
Archive Name :  Carvalho
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  non-pathogenic human atx3 (28Q) transfection
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-05
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  6_6_1.pvec
Note :  14-15 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Ataxin-3 phosphorylation decreases neuronal defects in spinocerebellar ataxia type 3 models.

Measurements
Soma Surface :  285.28 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  14
Overall Width :  77.51 μm
Overall Height :  73.3 μm
Overall Depth :  0.44 μm
Average Diameter :  0.53 μm
Total Length :  590.67 μm
Total Surface :  984.1 μm2
Total Volume :  130.48 μm3
Max Euclidean Distance :  66.4 μm
Max Path Distance :  75.87 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  411
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  1.77°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.66°
Fractal Dimension :  1.03

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