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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08709
Cell Name :  6R-E1-S3
Archive Name :  Brumberg
Species Name :  mouse
Strain :  ICR/Hsd
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  80.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  225  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-03-27
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  6R-E1-S3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological heterogeneity of layer VI neurons in mouse barrel cortex.

Measurements
Soma Surface :  435.07 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  15
Overall Width :  106.2 μm
Overall Height :  116.05 μm
Overall Depth :  49.9 μm
Average Diameter :  1.39 μm
Total Length :  558.82 μm
Total Surface :  2627.3 μm2
Total Volume :  1083.51 μm3
Max Euclidean Distance :  115.61 μm
Max Path Distance :  134.89 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  811
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.39
Average Bifurcation Angle Local :  66.01°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.26°
Fractal Dimension :  1.05

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