8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141471
Cell Name :  6602-5
Archive Name :  Cai
Species Name :  mouse
Strain :  ChAT-Cre
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  dorsolateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  nTracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Brainbow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  nTracer
Date of Deposition :  2019-05-28
Date of Upload :  2020-10-14
Persistence Vector :  6602-5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Multispectral tracing in densely labeled mouse brain with nTracer.

Measurements
Soma Surface :  5.82 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  6
Overall Width :  5.55 μm
Overall Height :  13.39 μm
Overall Depth :  25.08 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  249.83 μm
Total Surface :  196.22 μm2
Total Volume :  12.26 μm3
Max Euclidean Distance :  26.61 μm
Max Path Distance :  167.53 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.3
Total Fragmentation :  1996
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  4.44°
Average Bifurcation Angle Remote :  126.7°
Fractal Dimension :  1.75

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website