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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141455
Cell Name :  6602-3
Archive Name :  Cai
Species Name :  mouse
Strain :  ChAT-Cre
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  dorsolateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  nTracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Brainbow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  nTracer
Date of Deposition :  2019-05-28
Date of Upload :  2020-10-14
Persistence Vector :  6602-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Multispectral tracing in densely labeled mouse brain with nTracer.

Measurements
Soma Surface :  6.95 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  14
Overall Width :  8.41 μm
Overall Height :  10.64 μm
Overall Depth :  68.11 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  285.68 μm
Total Surface :  224.38 μm2
Total Volume :  14.02 μm3
Max Euclidean Distance :  64.51 μm
Max Path Distance :  104.53 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.69
Total Fragmentation :  1706
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  54.66°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.84°
Fractal Dimension :  1.28

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