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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141454
Cell Name :  6602-2
Archive Name :  Cai
Species Name :  mouse
Strain :  ChAT-Cre
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  dorsolateral
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  cholinergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  nTracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Brainbow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  nTracer
Date of Deposition :  2019-05-28
Date of Upload :  2020-10-14
Persistence Vector :  6602-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Multispectral tracing in densely labeled mouse brain with nTracer.

Measurements
Soma Surface :  2.25 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  61
Overall Width :  10.79 μm
Overall Height :  21.86 μm
Overall Depth :  78.31 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1081.78 μm
Total Surface :  849.63 μm2
Total Volume :  53.1 μm3
Max Euclidean Distance :  70.81 μm
Max Path Distance :  143.45 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.64
Total Fragmentation :  7006
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  91.8°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.99°
Fractal Dimension :  1.39

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