8.6.103 - Released: 2025-12-08 - Content: 285900 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_276980
Cell Name :  656705176_transformed
Archive Name :  Allen Cell Types
Species Name :  mouse
Strain :  Nos1-CreERT2;Ai14
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  54.0 days
Max Age :  54.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 2-3, left
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Neuronal Nitric Oxide Synthase (nNOS)-positive, Aspiny
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2020-10-02
Date of Upload :  2024-03-05
Persistence Vector :  656705176_transformed.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Integrated Morphoelectric and Transcriptomic Classification of Cortical GABAergic Cells.

Measurements
Soma Surface :  616.71 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  167
Number of Branches :  338
Overall Width :  262.78 μm
Overall Height :  577.65 μm
Overall Depth :  418.75 μm
Average Diameter :  0.29 μm
Total Length :  18969.4 μm
Total Surface :  17309.6 μm2
Total Volume :  1480.54 μm3
Max Euclidean Distance :  408 μm
Max Path Distance :  747.42 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  13901
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  87.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.65°
Fractal Dimension :  1.03

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