8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90388
Cell Name :  636d683400006d65492a16__vschuhbeck__91d3ad
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  0.03  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-17
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  636d683400006d65492a16__vschuhbeck__91d3ad.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-volume en-bloc staining for electron microscopy-based connectomics.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  5
Overall Width :  1.25 μm
Overall Height :  12.2 μm
Overall Depth :  4.51 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  21.7 μm
Total Surface :  17.05 μm2
Total Volume :  1.07 μm3
Max Euclidean Distance :  12.75 μm
Max Path Distance :  18.07 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  51
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  88.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  119.63°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website