8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_90371
Cell Name :  633497340000835f47d80d__lgeiser__492a2a
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium tetroxide/uranyl acetate
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  0.03  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-10-17
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  633497340000835f47d80d__lgeiser__492a2a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Large-volume en-bloc staining for electron microscopy-based connectomics.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  50
Overall Width :  4.05 μm
Overall Height :  10.35 μm
Overall Depth :  6.82 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  70.72 μm
Total Surface :  55.54 μm2
Total Volume :  3.47 μm3
Max Euclidean Distance :  7.87 μm
Max Path Distance :  18.4 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  260
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  102.27°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.06°
Fractal Dimension :  1.06

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