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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_49565
Cell Name :  6-5-JB
Archive Name :  Smith
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  43.0 days
Max Age :  43.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  ventral striatum
Tertiary Brain Region :  nucleus accumbens, shell
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Early withdrawal: 1 day post saline/nicotine
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-05-12
Date of Upload :  2016-09-01
Persistence Vector :  6-5-JB.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adolescent nicotine-induced dendrite remodeling in the nucleus accumbens is rapid, persistent, and D1-dopamine receptor dependent.

Measurements
Soma Surface :  552.5 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  36
Overall Width :  223.35 μm
Overall Height :  314.78 μm
Overall Depth :  56.96 μm
Average Diameter :  1.1 μm
Total Length :  2037.61 μm
Total Surface :  7115.06 μm2
Total Volume :  2075.18 μm3
Max Euclidean Distance :  207.13 μm
Max Path Distance :  244.55 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  2703
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  89.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.94°
Fractal Dimension :  1.02

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