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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_75707
Cell Name :  6-1-12-n05KO-4-neurite
Archive Name :  Higgs
Species Name :  mouse
Strain :  Rhot1
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  16.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2017-03-31
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  6-1-12-n05KO-4-neurite.pvec
Note :  14 days in vitro

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of Dendritic Complexity Precedes Neurodegeneration in a Mouse Model with Disrupted Mitochondrial Distribution in Mature Dendrites.

Measurements
Soma Surface :  112.83 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  92
Overall Width :  159.23 μm
Overall Height :  223.19 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.22 μm
Total Length :  1584.1 μm
Total Surface :  1199.9 μm2
Total Volume :  112.53 μm3
Max Euclidean Distance :  176.46 μm
Max Path Distance :  262.25 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1858
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.36
Average Bifurcation Angle Local :  79.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.06°
Fractal Dimension :  1.02

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