8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282961
Cell Name :  5_mod_T_160707_F1M1_loom_02
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1101tET
Structural Domains :  No Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  periventricular layer
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  looming-detector
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  photo-activatable green fluorescent protein (pa-GFP)
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.01  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-18
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  5_mod_T_160707_F1M1_loom_02.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Retinotectal circuitry of larval zebrafish is adapted to detection and pursuit of prey.

Measurements
Soma Surface :  449.21 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  35
Overall Width :  24.3 μm
Overall Height :  109.49 μm
Overall Depth :  13.21 μm
Average Diameter :  6.36 μm
Total Length :  323.75 μm
Total Surface :  6794.28 μm2
Total Volume :  13521.5 μm3
Max Euclidean Distance :  114.51 μm
Max Path Distance :  140.24 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  139
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  2.44
Average Bifurcation Angle Local :  94.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  97.2°
Fractal Dimension :  1.05

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