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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_156436
Cell Name :  5_L2_C4_N3
Archive Name :  Castanho_Oliveira
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6 Pld1-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Phospholipase D1 (PLD1) Knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water or oil
Magnification :  600x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-08-14
Date of Upload :  2021-06-10
Persistence Vector :  5_L2_C4_N3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Phospholipase D1 Ablation Disrupts Mouse Longitudinal Hippocampal Axis Organization and Functioning.

Measurements
Soma Surface :  1007.43 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  31
Number of Branches :  67
Overall Width :  120.99 μm
Overall Height :  330.91 μm
Overall Depth :  42.73 μm
Average Diameter :  0.07 μm
Total Length :  2247.02 μm
Total Surface :  494.14 μm2
Total Volume :  8.65 μm3
Max Euclidean Distance :  242.89 μm
Max Path Distance :  308.68 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  390
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  55.03°
Average Bifurcation Angle Remote :  47.43°
Fractal Dimension :  1.02

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