8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283262
Cell Name :  5946-1-6M-TC-R3-1-z15-90-soma
Archive Name :  Chen_Kuruvilla
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP;CaMKII-Wnt5afl/fl
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  wnt5a knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2019-05-06
Date of Upload :  2024-06-24
Persistence Vector :  5946-1-6M-TC-R3-1-z15-90-soma.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Wnt5a is essential for hippocampal dendritic maintenance and spatial learning and memory in adult mice.

Measurements
Soma Surface :  1836.04 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  66
Number of Branches :  137
Overall Width :  122.97 μm
Overall Height :  321.29 μm
Overall Depth :  34.89 μm
Average Diameter :  6.48 μm
Total Length :  3195 μm
Total Surface :  64613.9 μm2
Total Volume :  144803 μm3
Max Euclidean Distance :  237.62 μm
Max Path Distance :  252.64 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  6608
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  59.12°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.75°
Fractal Dimension :  1.01

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