8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_260194
Cell Name :  589MRRL_RHemi_S1_Z21_20x_C03
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  Itgb3fl/fl;Emx1cre;Thy1-GFP-M-positive
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Integrin subunit beta 3 (Itgb3) Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2023-04-12
Date of Upload :  2023-05-08
Persistence Vector :  589MRRL_RHemi_S1_Z21_20x_C03.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Integrin β3 regulates apical dendritic morphology of pyramidal neurons throughout hippocampal CA3.

Measurements
Soma Surface :  220.86 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  21
Overall Width :  255.4 μm
Overall Height :  196.94 μm
Overall Depth :  26.84 μm
Average Diameter :  1.95 μm
Total Length :  1571.19 μm
Total Surface :  10295.9 μm2
Total Volume :  6071.63 μm3
Max Euclidean Distance :  262.72 μm
Max Path Distance :  319.51 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  506
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2.11
Average Bifurcation Angle Local :  37.44°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.54°
Fractal Dimension :  1.01

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