8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_260231
Cell Name :  589MRRL_RHemi_S1_Z19_20x_C01
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  Itgb3fl/fl;Emx1cre;Thy1-GFP-M-positive
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Integrin subunit beta 3 (Itgb3) Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2023-04-12
Date of Upload :  2023-05-08
Persistence Vector :  589MRRL_RHemi_S1_Z19_20x_C01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Integrin β3 regulates apical dendritic morphology of pyramidal neurons throughout hippocampal CA3.

Measurements
Soma Surface :  194.25 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  19
Overall Width :  97.46 μm
Overall Height :  328.67 μm
Overall Depth :  19.57 μm
Average Diameter :  1.88 μm
Total Length :  1739.5 μm
Total Surface :  10950.6 μm2
Total Volume :  5999.79 μm3
Max Euclidean Distance :  377.91 μm
Max Path Distance :  423.35 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  591
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.86
Average Bifurcation Angle Local :  44.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  34.09°
Fractal Dimension :  1.01

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