8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_260182
Cell Name :  589MRRL_LHemi_S2_Z21_20x_C01
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  Itgb3fl/fl;Emx1cre;Thy1-GFP-M-positive
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer, left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Integrin subunit beta 3 (Itgb3) Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2023-04-12
Date of Upload :  2023-05-08
Persistence Vector :  589MRRL_LHemi_S2_Z21_20x_C01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Integrin β3 regulates apical dendritic morphology of pyramidal neurons throughout hippocampal CA3.

Measurements
Soma Surface :  183.91 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  23
Overall Width :  83.38 μm
Overall Height :  424.26 μm
Overall Depth :  14.61 μm
Average Diameter :  1.87 μm
Total Length :  2324.04 μm
Total Surface :  14237.7 μm2
Total Volume :  7511.12 μm3
Max Euclidean Distance :  482.46 μm
Max Path Distance :  517.63 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  781
Partition Asymmetry :  0.32
Average Rall's Ratio :  1.86
Average Bifurcation Angle Local :  44.35°
Average Bifurcation Angle Remote :  25.41°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website