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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_251868
Cell Name :  587FRRLLHemiS2Z2720xC01CA3-exported-000
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA3
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2022-12-14
Date of Upload :  2023-01-11
Persistence Vector :  587FRRLLHemiS2Z2720xC01CA3-exported-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Simultaneous 3D Cellular Positioning and Apical Dendritic Morphology of Transgenic Fluorescent Mouse CA3 Hippocampal Pyramidal Neurons

Measurements
Soma Surface :  224 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  17
Overall Width :  122.72 μm
Overall Height :  343.06 μm
Overall Depth :  25.72 μm
Average Diameter :  2.28 μm
Total Length :  1227.91 μm
Total Surface :  9256.91 μm2
Total Volume :  6167.34 μm3
Max Euclidean Distance :  388.02 μm
Max Path Distance :  431.82 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  378
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  25.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  31.13°
Fractal Dimension :  1.01

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