8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83594
Cell Name :  5731_7181_1528
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-06-13
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  5731_7181_1528.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  webKnossos: efficient online 3D data annotation for connectomics.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  24
Overall Width :  72.2 μm
Overall Height :  80.29 μm
Overall Depth :  38.03 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  517.86 μm
Total Surface :  813.45 μm2
Total Volume :  101.68 μm3
Max Euclidean Distance :  61.62 μm
Max Path Distance :  191.75 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  3316
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  96.65°
Average Bifurcation Angle Remote :  102.2°
Fractal Dimension :  1.06

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