8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_76853
Cell Name :  56dpi_WT2_S7_1
Archive Name :  Jongbloets
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  128.0 days
Max Age :  128.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  adult-born, glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein, immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-04-09
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  56dpi_WT2_S7_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Stage-specific functions of Semaphorin7A during adult hippocampal neurogenesis rely on distinct receptors.

Measurements
Soma Surface :  463.45 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  19
Overall Width :  111.27 μm
Overall Height :  161.93 μm
Overall Depth :  42 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1247.5 μm
Total Surface :  3950 μm2
Total Volume :  1069.39 μm3
Max Euclidean Distance :  185.64 μm
Max Path Distance :  210.96 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  377
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.85
Average Bifurcation Angle Local :  49.22°
Average Bifurcation Angle Remote :  36.24°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website