8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_136030
Cell Name :  558-2-R3
Archive Name :  Greathouse_Herskowitz
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.5 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-04-27
Date of Upload :  2020-07-29
Persistence Vector :  558-2-R3.pvec
Note :  nan

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct and complementary functions of rho kinase isoforms ROCK1 and ROCK2 in prefrontal cortex structural plasticity.

Measurements
Soma Surface :  934.7 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  87
Overall Width :  172.56 μm
Overall Height :  210.08 μm
Overall Depth :  74.46 μm
Average Diameter :  1.16 μm
Total Length :  2459.65 μm
Total Surface :  9220.73 μm2
Total Volume :  3241.44 μm3
Max Euclidean Distance :  140.52 μm
Max Path Distance :  168.75 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1455
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2.07
Average Bifurcation Angle Local :  67.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.72°
Fractal Dimension :  1.04

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