8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_136062
Cell Name :  558-1-L1
Archive Name :  Greathouse_Herskowitz
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.5 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-04-27
Date of Upload :  2020-07-29
Persistence Vector :  558-1-L1.pvec
Note :  nan

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct and complementary functions of rho kinase isoforms ROCK1 and ROCK2 in prefrontal cortex structural plasticity.

Measurements
Soma Surface :  540.22 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  85
Overall Width :  116.64 μm
Overall Height :  231.58 μm
Overall Depth :  71.73 μm
Average Diameter :  1.25 μm
Total Length :  2050.63 μm
Total Surface :  8344.74 μm2
Total Volume :  3280.54 μm3
Max Euclidean Distance :  156.1 μm
Max Path Distance :  192.39 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1233
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.92
Average Bifurcation Angle Local :  84.81°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.21°
Fractal Dimension :  1.03

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