8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_159689
Cell Name :  5-Som-3d-trace
Archive Name :  Adke_Carrasquillo
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  63.0 days
Max Age :  119.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  central
Tertiary Brain Region :  right
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-07-06
Date of Upload :  2021-07-20
Persistence Vector :  5-Som-3d-trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cell-Type Specificity of Neuronal Excitability and Morphology in the Central Amygdala.

Measurements
Soma Surface :  433.31 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  26
Overall Width :  173.87 μm
Overall Height :  281.2 μm
Overall Depth :  154.92 μm
Average Diameter :  0.88 μm
Total Length :  1905.82 μm
Total Surface :  5364.55 μm2
Total Volume :  1295.63 μm3
Max Euclidean Distance :  175.73 μm
Max Path Distance :  503.01 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1877
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  43.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.34°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website