8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_271628
Cell Name :  5-2_1_D
Archive Name :  Seo
Species Name :  mouse
Strain :  P301S::ApoE3/ApoE3
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  280.0 days
Max Age :  280.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  molecular layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  GFAP-positive
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Microbiota re-colonized mice
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-09-04
Date of Upload :  2023-09-13
Persistence Vector :  5-2_1_D.pvec
Note :  GF mice were colonized with fecal microbiota samples collected from 40 week old Conv-R TE4 mice to create Ex-GF animals.

Reference Article
Related Article Reference :  ApoE isoform- and microbiota-dependent progression of neurodegeneration in a mouse model of tauopathy.

Measurements
Soma Surface :  12.32 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  18
Overall Width :  49.22 μm
Overall Height :  34.98 μm
Overall Depth :  4 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  236.58 μm
Total Surface :  185.81 μm2
Total Volume :  11.61 μm3
Max Euclidean Distance :  35.56 μm
Max Path Distance :  39.56 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  642
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  35.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  37.23°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website