8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_98602
Cell Name :  5-10-2016-sl1-tracing
Archive Name :  Danzer
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.2 months
Max Age :  8.2 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  PTEN Knockout
Staining Method :  Streptavidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-25
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  5-10-2016-sl1-tracing.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  PTEN deletion increases hippocampal granule cell excitability in male and female mice.

Measurements
Soma Surface :  630.45 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  51
Overall Width :  236.26 μm
Overall Height :  279.71 μm
Overall Depth :  66.5 μm
Average Diameter :  0.36 μm
Total Length :  3485.3 μm
Total Surface :  4526.89 μm2
Total Volume :  494.38 μm3
Max Euclidean Distance :  244.34 μm
Max Path Distance :  286.67 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1392
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  1.83
Average Bifurcation Angle Local :  68.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  35.96°
Fractal Dimension :  1.03

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